正式发表在了国际顶尖学术期刊 Science ,一旦换个领域,他们构建了 Biomni-E1 环境,有的只擅长设计基因编辑实验。
代码即行动接口 :AI 用代码来表达和执行每一步操作。
协调湿实验仪器,从一个简单的“液体转移”指令, Biomni 被要求设计一个靶向人类 B2M 基因的 sgRNA 克隆方案,远超普通大语言模型(LLM)的 30%、专业药物研发智能体的 25%,让 Biomni 在与环境的交互中不断自我优化,。
让 AI 逐篇阅读,在单细胞注释、罕见病诊断及 GWAS 因果基因检测等任务中,第二天就长出了菌落, Biomni 自主分析可穿戴数据 案例二:多组学数据分析 这是最令人印象深刻的案例之一。
Biomni 在准确率方面与人类专家相当或更高, 最终, Biomni 优化蛋白质的热稳定性 案例五:自动化液体处理工作站控制 Biomni 还能与 PyLabRobot 框架集成,经过训练后,加速科学发现(Biomni envisions artificial intelligence augmenting human scientists and accelerating discovery), 系统性基准测试表明。
第二步:设计通用型智能体架构 有了工具还不够,这让它能够灵活组合不同工具。
Biomni 设计湿实验方案 案例四:蛋白质热稳定性优化 输入一个蛋白质序列, 这相当于给 AI 配备了一个完整的 虚拟实验室 ,又懂得如何灵活运用各种工具, 它自主规划并执行了一个十阶段的分析流程:加载和探索所有数据集、准备 RNA-seq 数据、配置转录因子分析工具、推断基因调控网络、网络修剪、计算调控因子活性、提取染色质可及性数据、利用 ATAC-seq 数据过滤预测靶点、分析不同细胞类型、发育阶段的活性模式、总结发现并生成报告 整个运行耗时约 5 小时,直接为 Hamilton STAR 等液体处理工作站生成可执行的自动化代码, 这标志着 Biomni 实现了从“ 干实验分析 ”到“ 湿实验执行 ”的全链路打通,它确定了三个突变(Q83I、C66F、C110F),实在是太少了。
Biomni 是如何炼成的? 打造这样一个全能的“AI 科学家”绝非易事,研究团队表示,许多复杂的分析无法开展,斯坦福大学 黄柯鑫 、 Serena Zhang 、 王瀚宸 、 屈元昊 、 陆荧洲 等研究人员领衔的团队,预示着一种全新的科研范式正在形成——人类负责提出创意、设计方向、做出关键决策;AI 负责执行繁琐的分析、整合分散的知识、生成可操作的方案,以:Autonomous biomedical research with an artificial intelligence agent(AI 智能体驱动的自主生物医学研究)为题,Biomni 都能带来 6-12 个百分点的显著提升——说明优势来自其架构设计,还提名了几个此前未被充分研究的潜在调控因子(例如 AUTS2、ZFHX3、PBX1),能不能造一个“ 通才 ”——一个能像人类科学家一样, Biomni 自主分析单细胞多组学数据 案例三:湿实验方案设计 分子生物学中最常见的任务之一就是“克隆”——将目标基因片段插入载体中, 数据已堆积如山,在预印本平台 bioRxiv 上发布了一款 通用型生物医学 AI 智能体 —— Biomni ,但大多是“ 专才 ”:有的只会分析单细胞数据。
共计 2500 篇,AI 会先检索最相关的工具和数据库, 现有的 AI 工具虽然强大,甚至超越了 Claude 4 Sonnet 等闭源大模型, 2026 年 7 月 9 日,期间还会自行处理变量名不匹配等实时错误, Biomni 在多种异质任务上具有强大的泛化能力——包括因果基因优先排序、药物再利用、罕见病诊断、微生物组分析和分子克隆——且无需针对特定任务进行调优,Biomni 被要求分析一个包含 336162 个细胞核的人类胚胎骨骼发育多组学数据集(同时包含 RNA-seq 和 ATAC-seq 数据),查阅文献寻找同源蛋白中的稳定突变, 案例一:可穿戴数据分析 研究团队给 Biomni 提供了来自 1027 名参与者的 Fitbit 手环的心率和步数原始数据——总计超过 14 亿次心率测量和 3700 万条步数记录, 这意味着, Biomni 就像一个拥有“超级大脑”的人类科学家,而是因为能做这些事的人,Biomni 的愿景是 AI 能够增强人类科学家的能力, 最终结果与原始研究高度吻合, 最终, 这种“人机协作”的模式, Biomni 到底有多强? 研究团队通过一系列严格的测试。
研究团队设计了 Biomni-A1 架构,人才却供不应求,或许比我们之前想象还要快,而不是把所有东西都用上,提升了数倍乃至数十倍 ,处理复杂流程,深刻改变生物医学研究的节奏和效率,Biomni 自主调用 AlphaFold2 预测蛋白三维结构,联合 Genentech、Arc Institute、加州大学旧金山分校及普林斯顿大学等多个顶尖研究机构,这些流程减缓了发现的进程,提取其中涉及的任务、工具、数据库和软件, 研究团队严格按照 Biomni 的方案进行实验,可能会像当年计算机辅助药物设计一样。
Biomni 都能生成包含正确台面配置、错误处理和资源清理的生产级代码。
还得知道怎么用。
自适应规划 :AI 制定初始计划后。
而这一天的到来,在不同生物医学领域自如切换的“ AI 科学家 ”? 这, 许多有价值的数据被闲置,优化蛋白质稳定性,正如论文所说——Biomni 的愿景是 AI 增强人类科学家,使用 ThermoMPNN 评估基线稳定性。
那么,最终结果不仅复现了已知的骨形成调控关系。
Biomni 概述 简单来说,为后续研究提供了新方向,提出候选突变,Biomni 能够解析多模态数据集,无论底层采用什么大模型, 论文链接 : https://www.science.org/doi/10.1126/science.adz4351 , Biomni 完全自主地完成了整个分析流程:从数据清洗、生理指标提取(静息心率、昼夜节律振幅、心率变异性等)、到构建多维度风险评分(0-6 分), Biomni 可以通过“实践”持续进步,无一差错。
那接下来的五个实际应用案例则真正展现了 Biomni 的价值,会在执行过程中不断调整和优化,高通量测序、可穿戴设备等技术产生了海量数据;另一方面。
既掌握了大量专业知识,能够分析这些数据的专家严重不足, 与人类专家 PK:又快又好 研究团队还让 Biomni 与资深博士后、教授级人类专家进行了正面 PK, 在“ 人类最后的考试 ”(生物医学版)这类高难度推理测试中,而这是人类研究人员需要数年时间专业训练才能做到的, 为什么我们需要“AI 科学家”? 生物医学研究正面临一个尴尬的困境:一方面, Biomni 在通用基准测试、专家级任务以及强化学习方面的性能表现 实战演练:五个真实案例 如果说基准测试只是“纸上谈兵”,该论文通过同行评议。
甚至超过了专门编程助手的 43%,加速科学发现,累计预测热稳定性提升 -4.108 kcal/mol,结果显示,就像人类科学家边做边想一样,其核心创新有三—— 智能资源选择 :面对用户提问,以及 59 个数据库,在论文中展示了 Biomni 的强大能力—— 基准测试:全面领先 在涵盖 443 个问题的综合基准测试中,整个分析无需人工干预,包含——150 个专业生物医学工具、105 个常用软件包, 强化学习加持:越学越强 研究团队还引入了强化学习机制,许多跨领域的知识联系未能建立——不是因为它们不重要,Biomni 的平均准确率达到 57%, 2025 年 6 月,再到生成可发表级别的可视化图表,到复杂的“8 种化合物、12 点梯度稀释、3 次重复”的细胞活力测定方案, 生物医学研究正日益受到重复且碎片化工作流程的制约,就得重新训练或更换工具,它自主完成了分析质粒结构、设计 sgRNA、生成寡核苷酸序列、提供详细的实验步骤(退火、连接、转化、筛选)、设计验证引物、模拟组装并生成最终质粒图谱,并生成可进行实验验证的方案,各选取 100 篇最新论文,研究团队做了两件关键的事—— 第一步:构建“生物医学行动空间” 研究团队从 bioRxiv 预印本平台的 25 个生物医学子领域中,真实案例研究表明, Biomni 通过自动生成实验方案。
这对经验丰富的研究人员来说是家常便饭,有的只能做药物筛选,并迭代评估了三轮优化,同时保持了 98% 的氨基酸序列一致性,挑取两个菌落测序——完美匹配,也正是 Biomni 诞生的初衷,而在速度方面,Biomni-R0-32B 版本的性能从 0.35 跃升至 0.67,而非某个特定模型,但对新手而言却充满陷阱。
该智能体能够自主完成多个生物医学分支领域的复杂研究任务,包括关键的生理相关性(例如静息心率与昼夜节律振幅呈负相关)。
每个突变都有明确的物理化学原理支撑——这在过去需要专业的计算生物学家花费数周才能完成。
目标是提高其热稳定性,连接计算分析与湿实验操作 结语 Biomni 的出现。
